Protein–RNA interactions for Protein: P05937

CALB1, Calbindin, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB1P05937 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALB1P05937 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALB1P05937 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALB1P05937 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALB1P05937 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALB1P05937 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALB1P05937 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALB1P05937 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALB1P05937 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALB1P05937 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALB1P05937 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALB1P05937 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALB1P05937 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALB1P05937 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALB1P05937 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALB1P05937 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALB1P05937 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CALB1P05937 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALB1P05937 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALB1P05937 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALB1P05937 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALB1P05937 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALB1P05937 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALB1P05937 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALB1P05937 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CALB1P05937 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CALB1P05937 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALB1P05937 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALB1P05937 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALB1P05937 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALB1P05937 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALB1P05937 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALB1P05937 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALB1P05937 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALB1P05937 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALB1P05937 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALB1P05937 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALB1P05937 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALB1P05937 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALB1P05937 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALB1P05937 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALB1P05937 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALB1P05937 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALB1P05937 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALB1P05937 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALB1P05937 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALB1P05937 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALB1P05937 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALB1P05937 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALB1P05937 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALB1P05937 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALB1P05937 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALB1P05937 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALB1P05937 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALB1P05937 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALB1P05937 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALB1P05937 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALB1P05937 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALB1P05937 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALB1P05937 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALB1P05937 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALB1P05937 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALB1P05937 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CALB1P05937 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALB1P05937 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALB1P05937 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALB1P05937 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CALB1P05937 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALB1P05937 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALB1P05937 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALB1P05937 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALB1P05937 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALB1P05937 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALB1P05937 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALB1P05937 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALB1P05937 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALB1P05937 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALB1P05937 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALB1P05937 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALB1P05937 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALB1P05937 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALB1P05937 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALB1P05937 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALB1P05937 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALB1P05937 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALB1P05937 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALB1P05937 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CALB1P05937 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CALB1P05937 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CALB1P05937 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CALB1P05937 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CALB1P05937 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CALB1P05937 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CALB1P05937 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CALB1P05937 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CALB1P05937 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CALB1P05937 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CALB1P05937 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CALB1P05937 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CALB1P05937 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms