Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
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LRRTM2O43300 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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LRRTM2O43300 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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LRRTM2O43300 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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LRRTM2O43300 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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LRRTM2O43300 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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LRRTM2O43300 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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