Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLGNO14967 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLGNO14967 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLGNO14967 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLGNO14967 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLGNO14967 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CLGNO14967 MDGA1-207ENST00000505425 3021 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLGNO14967 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLGNO14967 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLGNO14967 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLGNO14967 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLGNO14967 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CLGNO14967 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLGNO14967 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLGNO14967 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLGNO14967 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLGNO14967 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLGNO14967 MYRIP-203ENST00000425621 2981 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLGNO14967 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLGNO14967 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLGNO14967 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLGNO14967 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLGNO14967 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLGNO14967 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLGNO14967 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLGNO14967 AC112176.1-201ENST00000565428 3024 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CLGNO14967 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLGNO14967 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLGNO14967 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLGNO14967 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLGNO14967 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLGNO14967 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLGNO14967 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLGNO14967 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLGNO14967 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CLGNO14967 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLGNO14967 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLGNO14967 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLGNO14967 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLGNO14967 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLGNO14967 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLGNO14967 COL6A3-203ENST00000353578 9963 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLGNO14967 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLGNO14967 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLGNO14967 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLGNO14967 DAXX-202ENST00000374542 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLGNO14967 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLGNO14967 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLGNO14967 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLGNO14967 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CLGNO14967 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CLGNO14967 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLGNO14967 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLGNO14967 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLGNO14967 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLGNO14967 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CLGNO14967 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CLGNO14967 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CLGNO14967 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLGNO14967 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CLGNO14967 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CLGNO14967 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLGNO14967 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLGNO14967 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLGNO14967 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLGNO14967 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLGNO14967 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLGNO14967 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLGNO14967 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLGNO14967 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CLGNO14967 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLGNO14967 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLGNO14967 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLGNO14967 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLGNO14967 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLGNO14967 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CLGNO14967 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLGNO14967 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLGNO14967 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLGNO14967 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLGNO14967 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLGNO14967 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLGNO14967 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLGNO14967 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CLGNO14967 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLGNO14967 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CLGNO14967 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLGNO14967 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLGNO14967 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLGNO14967 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLGNO14967 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLGNO14967 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLGNO14967 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLGNO14967 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLGNO14967 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLGNO14967 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLGNO14967 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLGNO14967 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLGNO14967 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLGNO14967 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms