Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC13.65□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms