Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC15.03■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms