Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms