Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC78A2IDD5 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms