Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
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ARL2-SNX15V9GYD0 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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ARL2-SNX15V9GYD0 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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ARL2-SNX15V9GYD0 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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ARL2-SNX15V9GYD0 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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