Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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USP15Q9Y4E8 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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