Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 258.1 ms