Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms