Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.3 ms