Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.7 ms