Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms