Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NLRP1Q9C000 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NLRP1Q9C000 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NLRP1Q9C000 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NLRP1Q9C000 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NLRP1Q9C000 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NLRP1Q9C000 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NLRP1Q9C000 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
NLRP1Q9C000 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
NLRP1Q9C000 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NLRP1Q9C000 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
NLRP1Q9C000 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NLRP1Q9C000 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms