Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 ETFRF1-210ENST00000556927 833 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC114810.1-201ENST00000607415 473 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009283.1-201ENST00000615852 645 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 TPTE2P2-201ENST00000403471 1466 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 CREM-216ENST00000429130 1476 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 VTA1-201ENST00000367621 1284 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC004112.1-201ENST00000431064 561 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms