Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SRRTQ9BXP5 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SRRTQ9BXP5 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SRRTQ9BXP5 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SRRTQ9BXP5 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SRRTQ9BXP5 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SRRTQ9BXP5 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SRRTQ9BXP5 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SRRTQ9BXP5 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SRRTQ9BXP5 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SRRTQ9BXP5 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SRRTQ9BXP5 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SRRTQ9BXP5 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SRRTQ9BXP5 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRRTQ9BXP5 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRRTQ9BXP5 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRRTQ9BXP5 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRRTQ9BXP5 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRRTQ9BXP5 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRRTQ9BXP5 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRRTQ9BXP5 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms