Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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SMIM2Q9BVW6 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SMIM2Q9BVW6 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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