Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC11.1□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 WDR27-203ENST00000448612 3178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 NPR2-201ENST00000342694 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.1□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 PIGG-208ENST00000504346 3019 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 NRXN1-210ENST00000406316 9375 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 ADPRH-201ENST00000357003 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 CACNA2D3-AS1-201ENST00000471265 2078 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 GADL1-201ENST00000282538 3759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 PACSIN1-207ENST00000620693 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 TMEM168-201ENST00000312814 7470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 GOLGA3-201ENST00000204726 9252 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 PARP10-205ENST00000525773 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 GOLGA6L4-202ENST00000422563 4155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 PHC2-201ENST00000257118 3870 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 SP7-202ENST00000536324 3151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 GPC3-201ENST00000370818 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 NHSL1-204ENST00000427025 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 RPS6KA1-220ENST00000531382 2359 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 ST3GAL2-202ENST00000393640 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 NFATC4-209ENST00000553879 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 ESYT1-202ENST00000394048 4388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 DDX5-210ENST00000578804 2021 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 FP325332.1-201ENST00000624818 2045 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 HECW1-IT1-201ENST00000322220 1839 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 NR1D1-201ENST00000246672 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 SRRM5-201ENST00000417606 2381 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 EPB42-202ENST00000441366 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms