Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC4

ZNF479, Zinc finger protein 479, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF479Q96JC4 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 SNHG20-202ENST00000434411 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 FAM120C-202ENST00000375180 8057 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 DYNC1LI1-201ENST00000273130 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ZNF479Q96JC4 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms