Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-CQ95604 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-CQ95604 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-CQ95604 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-CQ95604 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-CQ95604 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-CQ95604 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-CQ95604 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-CQ95604 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-CQ95604 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-CQ95604 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-CQ95604 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-CQ95604 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-CQ95604 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-CQ95604 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-CQ95604 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-CQ95604 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-CQ95604 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-CQ95604 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-CQ95604 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-CQ95604 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-CQ95604 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-CQ95604 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-CQ95604 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HLA-CQ95604 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-CQ95604 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-CQ95604 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-CQ95604 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-CQ95604 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HLA-CQ95604 IL20RB-AS1-201ENST00000462176 562 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-CQ95604 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HLA-CQ95604 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-CQ95604 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-CQ95604 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-CQ95604 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HLA-CQ95604 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HLA-CQ95604 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-CQ95604 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-CQ95604 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-CQ95604 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-CQ95604 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HLA-CQ95604 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-CQ95604 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-CQ95604 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-CQ95604 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-CQ95604 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-CQ95604 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-CQ95604 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-CQ95604 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-CQ95604 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-CQ95604 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-CQ95604 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-CQ95604 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-CQ95604 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-CQ95604 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-CQ95604 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-CQ95604 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-CQ95604 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-CQ95604 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-CQ95604 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-CQ95604 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-CQ95604 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-CQ95604 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-CQ95604 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-CQ95604 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-CQ95604 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-CQ95604 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-CQ95604 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-CQ95604 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-CQ95604 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-CQ95604 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-CQ95604 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-CQ95604 CCL25-202ENST00000315626 450 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-CQ95604 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HLA-CQ95604 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-CQ95604 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-CQ95604 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-CQ95604 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-CQ95604 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HLA-CQ95604 AC010900.1-201ENST00000449849 1296 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HLA-CQ95604 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-CQ95604 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-CQ95604 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-CQ95604 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-CQ95604 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-CQ95604 AC011489.1-201ENST00000586744 690 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-CQ95604 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HLA-CQ95604 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-CQ95604 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
HLA-CQ95604 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HLA-CQ95604 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HLA-CQ95604 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HLA-CQ95604 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HLA-CQ95604 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HLA-CQ95604 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HLA-CQ95604 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HLA-CQ95604 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HLA-CQ95604 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HLA-CQ95604 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HLA-CQ95604 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms