Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCG3Q8WXD2 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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