Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 NFASC-225ENST00000539706 10135 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 KCNAB2-206ENST00000378097 4201 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 FHDC1-201ENST00000260008 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 HECTD4-202ENST00000377560 15759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 KCNAB2-202ENST00000341524 4207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 ABCC8-201ENST00000302539 4923 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 MARCH3-201ENST00000308660 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 AC015818.9-201ENST00000591705 4582 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 RIMKLA-202ENST00000431473 8909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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COPS9Q8WXC6 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 SPTB-204ENST00000389722 10063 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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COPS9Q8WXC6 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 CCDC14-220ENST00000488653 4156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 PIK3AP1-201ENST00000339364 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
COPS9Q8WXC6 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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