Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms