Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms