Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ANKRD42Q8N9B4 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms