Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC12.49□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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