Protein–RNA interactions for Protein: Q8N488

RYBP, RING1 and YY1-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYBPQ8N488 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms