Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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