Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms