Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms