Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms