Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms