Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZHG4

FNDC1, Fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC1Q4ZHG4 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.3 ms