Protein–RNA interactions for Protein: Q17RQ9

NKPD1, NTPase KAP family P-loop domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKPD1Q17RQ9 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
NKPD1Q17RQ9 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms