Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
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