Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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