Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 NRXN1-210ENST00000406316 9375 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 ARFGEF1-201ENST00000262215 7225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 LDB3-205ENST00000429277 5436 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 MYLK-204ENST00000360304 7738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 TMEM131L-203ENST00000409959 5017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 MAML3-203ENST00000509479 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms