Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 OSBP2-208ENST00000437268 3580 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 CRHR2-201ENST00000341843 3131 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 SHOX-203ENST00000381578 3757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 EPHA5-201ENST00000273854 8266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 IYD-208ENST00000500320 2158 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 IVD-203ENST00000479013 4251 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 TMCC2-208ENST00000545499 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 FNBP4-201ENST00000263773 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 PCDHB15-201ENST00000231173 4017 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 GBP1P1-201ENST00000394662 1740 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 RALGPS2-203ENST00000367634 7512 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 SLIT2-202ENST00000503823 5233 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 FOSB-206ENST00000586615 3774 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 SEC16A-206ENST00000431893 6465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 NEPRO-201ENST00000314400 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 ZNF473-205ENST00000595661 4828 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 FHOD3-207ENST00000591635 3035 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 GPR55-205ENST00000622008 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 DYNC1I1-204ENST00000437599 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 CYTH1-210ENST00000589297 3756 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 TNKS-213ENST00000522110 2900 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 TJP2-209ENST00000539225 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 RBM20-201ENST00000369519 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 MASP1-203ENST00000337774 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 POTEI-203ENST00000631234 2072 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 LILRB3-203ENST00000391750 2848 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 C1RL-201ENST00000266542 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 GRK7-201ENST00000264952 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 WWP2-202ENST00000359154 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 TXLNG-202ENST00000398155 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 KCNT1-213ENST00000630792 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 BCDIN3D-AS1-201ENST00000548872 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 NLRP7-201ENST00000328092 3299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 UBR7-201ENST00000013070 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 PM20D1-201ENST00000367136 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 DCLRE1C-210ENST00000378289 3532 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 WIPF1-204ENST00000392547 4587 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 LINC00656-201ENST00000443744 1896 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 DUSP10-201ENST00000366899 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 TRPC4-206ENST00000379705 4059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 MTHFR-203ENST00000376585 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
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