Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms