Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 LST1-205ENST00000376089 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 LST1-206ENST00000376090 689 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 LST1-209ENST00000376096 565 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 LST1-210ENST00000376099 610 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 LST1-212ENST00000396101 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 LST1-214ENST00000418507 726 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 LST1-217ENST00000438075 764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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