Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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NCAPHQ15003 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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