Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
GAPVD1Q14C86 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 AC019294.2-203ENST00000569596 594 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 FXYD6-208ENST00000529335 708 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GAPVD1Q14C86 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms