Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFIXQ14938 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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