Protein–RNA interactions for Protein: Q14865

ARID5B, AT-rich interactive domain-containing protein 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5BQ14865 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARID5BQ14865 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARID5BQ14865 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARID5BQ14865 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARID5BQ14865 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARID5BQ14865 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARID5BQ14865 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARID5BQ14865 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARID5BQ14865 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARID5BQ14865 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARID5BQ14865 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARID5BQ14865 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARID5BQ14865 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARID5BQ14865 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARID5BQ14865 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARID5BQ14865 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARID5BQ14865 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARID5BQ14865 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARID5BQ14865 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARID5BQ14865 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARID5BQ14865 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARID5BQ14865 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARID5BQ14865 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARID5BQ14865 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARID5BQ14865 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ARID5BQ14865 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARID5BQ14865 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARID5BQ14865 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARID5BQ14865 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARID5BQ14865 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARID5BQ14865 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ARID5BQ14865 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARID5BQ14865 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARID5BQ14865 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARID5BQ14865 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARID5BQ14865 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARID5BQ14865 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARID5BQ14865 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARID5BQ14865 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ARID5BQ14865 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARID5BQ14865 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARID5BQ14865 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARID5BQ14865 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARID5BQ14865 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARID5BQ14865 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARID5BQ14865 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARID5BQ14865 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARID5BQ14865 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARID5BQ14865 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARID5BQ14865 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARID5BQ14865 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARID5BQ14865 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARID5BQ14865 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARID5BQ14865 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARID5BQ14865 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARID5BQ14865 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARID5BQ14865 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARID5BQ14865 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARID5BQ14865 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARID5BQ14865 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARID5BQ14865 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARID5BQ14865 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARID5BQ14865 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARID5BQ14865 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ARID5BQ14865 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARID5BQ14865 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARID5BQ14865 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ARID5BQ14865 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARID5BQ14865 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARID5BQ14865 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARID5BQ14865 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARID5BQ14865 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARID5BQ14865 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARID5BQ14865 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARID5BQ14865 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ARID5BQ14865 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARID5BQ14865 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARID5BQ14865 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ARID5BQ14865 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARID5BQ14865 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARID5BQ14865 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARID5BQ14865 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARID5BQ14865 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARID5BQ14865 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARID5BQ14865 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARID5BQ14865 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARID5BQ14865 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ARID5BQ14865 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ARID5BQ14865 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARID5BQ14865 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARID5BQ14865 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARID5BQ14865 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARID5BQ14865 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARID5BQ14865 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARID5BQ14865 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARID5BQ14865 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARID5BQ14865 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARID5BQ14865 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARID5BQ14865 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARID5BQ14865 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms