Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 AL645937.6-201ENST00000641122 3727 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 AC092723.2-201ENST00000624955 793 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 AC015712.2-201ENST00000560351 3688 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NBR1Q14596 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms