Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA9Q13797 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA9Q13797 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA9Q13797 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA9Q13797 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA9Q13797 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA9Q13797 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA9Q13797 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA9Q13797 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA9Q13797 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ITGA9Q13797 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA9Q13797 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA9Q13797 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA9Q13797 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA9Q13797 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA9Q13797 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA9Q13797 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA9Q13797 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ITGA9Q13797 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA9Q13797 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA9Q13797 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA9Q13797 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA9Q13797 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA9Q13797 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA9Q13797 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA9Q13797 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA9Q13797 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA9Q13797 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA9Q13797 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA9Q13797 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA9Q13797 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA9Q13797 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA9Q13797 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA9Q13797 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA9Q13797 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA9Q13797 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ITGA9Q13797 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA9Q13797 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA9Q13797 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA9Q13797 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA9Q13797 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA9Q13797 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA9Q13797 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA9Q13797 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA9Q13797 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA9Q13797 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA9Q13797 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA9Q13797 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA9Q13797 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA9Q13797 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA9Q13797 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA9Q13797 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ITGA9Q13797 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA9Q13797 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA9Q13797 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA9Q13797 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA9Q13797 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ITGA9Q13797 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA9Q13797 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA9Q13797 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA9Q13797 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA9Q13797 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA9Q13797 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ITGA9Q13797 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA9Q13797 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA9Q13797 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA9Q13797 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA9Q13797 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA9Q13797 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA9Q13797 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA9Q13797 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms