Protein–RNA interactions for Protein: Q13569

TDG, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDGQ13569 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TDGQ13569 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TDGQ13569 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TDGQ13569 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TDGQ13569 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TDGQ13569 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TDGQ13569 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TDGQ13569 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TDGQ13569 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TDGQ13569 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TDGQ13569 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TDGQ13569 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TDGQ13569 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TDGQ13569 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TDGQ13569 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TDGQ13569 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TDGQ13569 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TDGQ13569 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TDGQ13569 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TDGQ13569 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TDGQ13569 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TDGQ13569 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TDGQ13569 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TDGQ13569 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TDGQ13569 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TDGQ13569 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TDGQ13569 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TDGQ13569 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TDGQ13569 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TDGQ13569 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TDGQ13569 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TDGQ13569 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TDGQ13569 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TDGQ13569 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TDGQ13569 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TDGQ13569 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TDGQ13569 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TDGQ13569 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TDGQ13569 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TDGQ13569 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TDGQ13569 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TDGQ13569 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TDGQ13569 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TDGQ13569 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TDGQ13569 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TDGQ13569 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TDGQ13569 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TDGQ13569 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TDGQ13569 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TDGQ13569 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TDGQ13569 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TDGQ13569 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TDGQ13569 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TDGQ13569 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TDGQ13569 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TDGQ13569 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TDGQ13569 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TDGQ13569 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TDGQ13569 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TDGQ13569 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TDGQ13569 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TDGQ13569 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TDGQ13569 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TDGQ13569 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TDGQ13569 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TDGQ13569 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TDGQ13569 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TDGQ13569 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TDGQ13569 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TDGQ13569 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TDGQ13569 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TDGQ13569 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TDGQ13569 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TDGQ13569 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TDGQ13569 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TDGQ13569 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TDGQ13569 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TDGQ13569 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TDGQ13569 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TDGQ13569 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TDGQ13569 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TDGQ13569 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TDGQ13569 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TDGQ13569 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TDGQ13569 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TDGQ13569 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TDGQ13569 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TDGQ13569 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TDGQ13569 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TDGQ13569 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TDGQ13569 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TDGQ13569 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TDGQ13569 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TDGQ13569 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TDGQ13569 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TDGQ13569 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TDGQ13569 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TDGQ13569 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TDGQ13569 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TDGQ13569 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms