Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 SLC25A35-203ENST00000579192 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 SLC13A4-201ENST00000354042 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 RC3H2-201ENST00000335387 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 SPINT1-201ENST00000344051 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 ATF6B-209ENST00000375201 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 ATF6B-210ENST00000375203 2620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 EPM2A-207ENST00000611340 2786 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 MAP2-201ENST00000199940 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 CACNB1-202ENST00000394303 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 PRKAB1-205ENST00000540121 1673 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 AC004834.1-202ENST00000638785 1737 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 CPNE1-201ENST00000317677 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 TRPM5-201ENST00000155858 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 PTGR2-204ENST00000555228 2543 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 ALDH9A1-201ENST00000354775 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
LSAMPQ13449 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 TNFSF8-201ENST00000223795 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 CSNK1G1-205ENST00000607537 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 AC112176.1-201ENST00000565428 3024 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 BAG6-247ENST00000439687 3104 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 PI4KAP2-211ENST00000486209 3213 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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