Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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CLN3Q13286 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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CLN3Q13286 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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CLN3Q13286 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
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CLN3Q13286 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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CLN3Q13286 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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CLN3Q13286 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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CLN3Q13286 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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CLN3Q13286 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
CLN3Q13286 PMCHL1-203ENST00000423301 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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